斯卡拉歌剧院芭蕾舞团拥有辉煌的历史，其起源可以追溯至世界上最负盛名的音乐剧院——斯卡拉歌剧院于1778年开幕之前的数个世纪。即使是在1813年“斯卡拉皇家帝国芭蕾舞学院”成立之前，杰出的编舞家如加斯帕罗·安焦利尼和萨尔瓦托雷·维加诺便已对欧洲芭蕾舞界产生了巨大影响。随后，卓越的舞蹈教师和理论家卡洛·布拉西斯将芭蕾引入了浪漫主义的氛围，从而促成了其风格的技术革新，并培养出了一批明星舞者。在十九世纪中叶，这批舞者征服了欧美各地的剧院，其中包括卡洛塔·格里西、范妮·塞里托等人。1890年，另一位大师恩里克·切凯蒂应召前往俄罗斯的圣彼得堡帝国剧院。他在那里传授意大利学派的教学技巧，并对培养安娜·巴甫洛娃、米哈伊尔·福金、塔玛拉·卡萨文娜和瓦茨拉夫·尼金斯基等学生起到了至关重要的作用。仅凭这些名字便足以说明他们达到的艺术高度，尤其是当谢尔盖·佳吉列夫邀请他们加入俄国芭蕾舞团，在巴黎和全世界展现其伟大才华之时。切凯蒂于1910年加入佳吉列夫的舞团并一直工作到1918年，之后以斯卡拉歌剧院芭蕾舞学校校长的身份结束了自己的职业生涯。
  由此，斯卡拉歌剧院芭蕾舞进入了二十世纪，这同样得益于来自佳吉列夫舞团的杰出编舞家，如米哈伊尔·福金和列昂尼德·马辛。来自中欧自由表现主义舞蹈世界的新名字也陆续出现，例如奥雷利奥·米洛什——二战结束后，阿图罗·托斯卡尼尼委托他重建舞团。为了丰富剧目，米洛什邀请了许多伟大的音乐家、著名的布景设计师和画家，以及乔治·巴兰钦这样的著名客座艺术家。在二十世纪五六十年代，斯卡拉歌剧院成为了向世界芭蕾明星开放的舞台。编舞家罗兰·佩蒂和莫里斯·贝嘉分别于1963年和1971年在此首演。明星舞者则包括卡拉·弗拉奇（一位深受爱戴的国际芭蕾明星，直至她于2021年5月去世）、莉莉安娜·科西、卢恰娜·萨维尼亚诺和保罗·博尔托卢齐。玛戈·芳婷、伊薇特·肖维雷、弗拉基米尔·瓦西里耶夫以及令人难忘的鲁道夫·努里耶夫也都曾作为客座艺术家在此演出。努里耶夫自1965年起与斯卡拉建立了紧密联系，其多部编舞作品被保留在舞团剧目中，而他也深受观众近乎狂热的喜爱。
  与此同时，斯卡拉歌剧院芭蕾舞团的国际知名度持续提升，曾赴巴黎歌剧院、美国、莫斯科大剧院、圣彼得堡马林斯基-基洛夫剧院、德国、土耳其、巴西、西班牙、墨西哥、中国和澳大利亚等地演出。其表现力和技术魅力由两位明星舞者保障：罗伯托·波雷和马西莫·穆鲁。甚至一些年轻的首席舞者、独舞者和群舞演员也在已故的伊丽莎白·泰拉布斯特的提携下担任了主要角色。泰拉布斯特曾是斯卡拉精力充沛的领导者，任期从1993年至1997年——在此期间她认可了亚历桑德拉·费莉的价值，费莉在1992年至2007年间是斯卡拉歌剧院的最高荣誉首席（又：终身首席荣誉称号）——并在2008年短暂地再次领导舞团。2009年，马哈尔·瓦泽耶夫成为首位领导斯卡拉歌剧院芭蕾舞团的俄罗斯人，更确切地说是奥塞梯人艺术总监。他的指导方针从一开始就很明确：强化二十世纪最杰出的剧目；复排传统古典作品，通常是采用原始的俄罗斯重构版本；为年轻舞者和编舞家提供机会；邀请伟大的指挥家重返指挥台，既作为额外的吸引力，也标志着斯卡拉芭蕾制作所需的水准。
  2015年，他被莫斯科大剧院召回俄罗斯，但瓦泽耶夫留下了一个技术无可挑剔的舞团——拥有抒情风格的明星舞者斯韦特兰娜·扎哈罗娃（她已在2007-2008演出季接替了亚历桑德拉·费莉）——并将舞团交给了马乌洛·比贡泽蒂。然而，这位世界闻名的意大利艺术家很快就因健康问题被迫放弃了这一职位。2016年10月，芭蕾舞团的领导权再次交托给弗雷德里克·奥利维耶里，他曾于2002年至2007年期间担任此职。他以新的活力扩大了舞团的阵容，任命了尼科莱塔·曼尼、克劳迪奥·科维罗等为首席舞者，以及马西莫·加龙、马尔科·阿戈斯蒂诺等为独舞演员。他的成就之一是与巴兰钦信托基金会建立了联系，并借此获得了《仲夏夜之梦》（常在巡演中上演）和《胡桃夹子》的演出权。舞团剧目也随着现当代芭蕾最重要人物的作品而增长：从伊利·基里安到杰罗姆·罗宾斯，从安热兰·普雷洛卡到韦恩·麦格雷戈，并且伴随着费莉的回归。
  随着剧院管理层从亚历山大·佩雷拉变更为多米尼克·梅耶，芭蕾舞团也在2020年12月迎来了一位新总监：巴黎人曼努埃尔·勒格里。他于1986年被时任巴黎国家歌剧院芭蕾舞团总监的鲁道夫·努里耶夫授予“明星首席”称号。勒格里在巴黎歌剧院舞蹈学校接受教育，并凭借其天赋跳过所有等级直接进入舞团，成为一位真正的艺术大师。得益于他的多才多艺，他几乎演遍了所有角色，受到了全球各舞团的邀请，并被顶尖编舞家们所青睐。在告别巴黎歌剧院的舞台后，他从2010年至2020年执掌维也纳国家芭蕾舞团及其附属芭蕾舞学院，使维也纳舞团成为享有国际声誉的团体，并开始创作编舞。在斯卡拉歌剧院，他安排了一些非常受欢迎的线上混合节目，其中包括一些大师课，由明星如卡拉·弗拉奇（生前曾指导《吉赛尔》）和亚历桑德拉·费莉授课。
  他担任总监期间的指导方针仍然坚定地基于传统和对新事物的开放态度，这意味着为年轻人提供机会，包括角色的快速轮换，也为附加舞者提供机会，例如尼科拉·德尔·弗雷奥、马尔科·阿戈斯蒂诺和爱丽丝·马里亚尼晋升为首席舞者，琳达·朱贝利、卡米拉·切鲁利等成为新的独舞演员。一个新的开始总是意味着有待通过芭蕾语言去发现和赞美的名字、面孔和身体。这得到了以下事件的印证：2023年11月8日，在《奥涅金》演出结束后，剧院经理兼艺术总监多米尼克·梅耶与芭蕾舞团总监曼努埃尔·勒格里在舞台上宣布，任命尼科莱塔·曼尼为斯卡拉歌剧院的新任明星首席；以及由弗雷德里克·奥利维耶里自2025年3月1日起第三次担任芭蕾舞团总监所保障的学校与舞团之间的连续性。